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NAMD Benchmark

NAMDの公式ホームページで公開されているベンチマーク(http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/utilities/)を実行しました。継続的にデータを取得してまいります。「s/step」、「days/ns」共に値が小さいほどパフォーマンスが高いことを示します。

stmv 
1,066,628 atoms, 12A cutoff + PME every 4 steps, periodic
Apoa1 
92,224 atoms, 12A cutoff + PME every 4 steps, periodic
f1atpase 
327,506 atoms, 11A cutoff + PME every 4 steps, periodic

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