分子動力学計算シミュレーション
AMBER

 AMBERはカリフォルニア大学のコールマン教授らのグループによって開発されたモデリングおよび分子力学・動力学計算シミュレーションプログラムです。GPUに対応し、並列動作が可能です。弊社では、ライセンスの手配から、AMBERのビルド、ジョブ管理ソフトとの連携等、お客様がアプリケーションをお使いになる上で必要な様々な作業を御支援可能です。

 本ページでは、The pmemd.cuda GPU Implementation (ambermd.org) で公開されているベンチマークデータについて、弊社での独自の検証作業を公開致します。計算機及び開発環境の選定の指標にしてください。結果データの単位はns/dayですので、値が大きいほど性能が高いことを意味します。