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HPC構成例

2007年下期クラスタ構成と価格

▽ 中型WSクラスタ
▽ 大型WSクラスタ
▽ ラック搭載クラスタ
▽ 高性能ファイルサーバ

 

HPCクラスタ (作成中)

ファイルサーバ (作成中)

WindowsCCS (作成中)

ラック搭載クラスタ構成と価格 - 2007Q4

小・中規模クラスタ32コア:480万円64コア:890万円128コア:1390万円64コア+スクラッチディスク:1070万円96コア+スクラッチディスク:1290万円
大規模クラスタ256コア:1980万円管理部:450万円512コア:4980万円1024コア:9980万円
InfiniBandオプション高速・大容量スクラッチディスク・オプションEIA-24U, 48Uラック・オプション

今期導入や来期予算申請に必要な、構成図、見積り、入札書類を迅速に作成

ホームページの構成をお客様のご要望に沿ってカスタマイズし、その見積書や構成図をすぐお送りします。入札に必要なカタログや資料類も整えています。お問い合わせは電話03-6410-6070、FAX03-6410-6073、メールinfo@hpc-technologies.co.jp でお願いします。

高性能HPCを標準化する『HPC-ProCluster Std.』を採用

◇ 高性能・高品質なDellのハードウェアを採用
◇ 汎用性を考慮してRedHat (CentOS)を選択
◇ HPCで必要なOSパッケージをフルインストール
◇ 標準的なLinux構成に準拠した設定で使い易い
◇ ネットワークやデーモン、サービス類をカスタマイズ
◇ 最適な開発環境やライブラリなどを選択して設定
◇ 安心できる3年間オンサイトサポートの提供

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低騒音1Uサーバ、標準2Uサーバでの、ラック搭載HPCクラスタ構成と価格

プロセッサのマルチコア化と64bit化によりHPCクラスタの実用性が向上しています。それを用いたHPCテクノロジーズのHPCクラスタは非常に完成度の高いものになっています。以下にその長所をまとめました。

◇ Quad-Core Xeonを搭載し最高水準の性能を実現
◇ ラック1台のスペースで多数のCPUコアを搭載可能 (最大336コア)
◇ 1Uサーバでも最大32GBメモリ搭載可能
◇ 大規模並列計算はInfiniBandの搭載で高速化可能
◇ アーキテクチャから開発環境まで環境の一貫性が保てる
◇ ストレージ性能への要求には10GbE標準採用で対応

◇ 『HPC-ProCluster Std.』によりHPC構築技術が均質化され安心して導入
◇ システム構築からオンサイト設置、専門技術者による運用支援まで実施
◇ LSFの導入で計算リソースの有効活用
◇ 管理サーバやファイルサーバも拡張性が高い

◇ 動作音が低く居室にも設置できる
◇ Dellのワークステーションを採用することで高品質化
◇ ヒートシンクにヒートパイプを採用し高い冷却性能を実現
◇ DellのサポートとHPCテクノロジーズによる安心の3年間オンサイトWサポート

※ 3年間の当時オンサイト保守なら、万一のディスク故障でも当日か翌営業日には修理担当がその場で修理。
※ 3年間の当時オンサイト保守では、部品費用も修理費用も一切無料です。
※ 面倒で時間もかかるセンドバックは昔の話。ファイルサーバには『3年間の当日オンサイト保守』必要不可欠。

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Xeon 4node 8CPU 32core 32GBメモリ + ホスト機 : 5,040,000円 (税込み)

大規模並列計算を必要とするMD計算や流体計算などの求めに応える仕様
研究室の多数の方が共同利用できるHPCクラスタ
InfiniBandスイッチをオプション設定

◆ 計算サーバ : DPe1950 4node 8CPU 32core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 3.0GHz 8core/node
◇ メモリ : 8GB/node
◇ システムディスク : 250GB SATA
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 管理サーバ兼ファイルサーバ : DPe2920 1node 1CPU 4core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 4core/node
◇ メモリ : 4GB/node
◇ システムディスク : ストレージと共有
◇ ストレージ : 1TB (RAID10 + スペア 500GB x5)
◇ 10GbE NIC : 1ポート
◇ 電源 : 2重化電源
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 開発環境 : Intel Fortran、C/C++、MKL、Intel-MPI (オプション)
※ MPI並列利用時、IB搭載時はIntel-MPIは必須
※ 開発環境ライセンスタイプは利用状況に応じて選択
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ 管理機能 : ホームディレクトリ、開発環境、ライセンス、ユーザ情報、ジョブ管理
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ その他
◇ ネットワーク : 10GbE対応の24ポートGbEスイッチ (10GbE x2、GbE x24)
◇ EIAラック : 24U or 42U (選択可能)
◇ オンサイト作業 : オンサイト・セットアップ
◇ 輸送費

お勧めポイント

◇ メモリはコアあたり1GB搭載
◇ 極めて信頼性の高いRAID10によるストレージを搭載
◇ ストレージ性能への要求に応える10GbEを標準採用
◇ MPI並列、ノード内並列、非並列などの計算をLSF経由で混在投入可
◇ LSFの採用によりシステムアイドル時間が低下し利用効率が大幅に向上
◇ 管理サーバを分離することでシステムがより安定稼動
◇ EIAラックのラックスペースに余裕があり大規模クラスタへの発展が可能
◇ 恒常性のある拡張を考慮して『HPC-ProCluster Std.』を採用
◇ アーキテクチャから開発環境まで環境の一貫性が保てる

※ ワークステーションベースの構成と比較すると少し割高ですが、ラックと10GbE対応スイッチの費用を考慮するとそれ程でもないことにお気づきになると思います。ラックマウントタイプは、ここから拡張する場合にスペースのロスがありません設置スペースに限りのある場所にはうってつけです。

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Xeon 8node 16CPU 64core 128GBメモリ + ホスト機 : 9,345,000円 (税込み)

大規模並列計算を必要とするMD計算や流体の要求に応えるコア数
高速ネットワークにもオプション対応
研究室の多数の方が共同利用できるHPCクラスタ

◆ 計算サーバ : DPe1950 8node 64core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 3.0GHz 8core/node
◇ メモリ : 16GB/node
◇ システムディスク : 250GB SATA
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 管理サーバ兼ファイルサーバ : DPe2920 1node 4core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 4core/node
◇ メモリ : 4GB/node
◇ システムディスク : 80GB (RAID1 80GB x2)
◇ SAS接続外付けストレージ : 2TB (RAID10 + スペア 500GB x9)
◇ 10GbE NIC : 1ポート
◇ 電源 : 2重化電源
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 開発環境 : Intel Fortran、C/C++、MKL、Intel-MPI (オプション)
※ MPI並列利用時、IB搭載時はIntel-MPIは必須
※ 開発環境ライセンスタイプは利用状況に応じて選択
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ 管理機能 : ホームディレクトリ、開発環境、ライセンス、ユーザ情報、ジョブ管理
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 高速システムインターコネクト SDR 10Gbps (オプション、別途220万円)
◇ InfiniBand SDR 24port SW : 1台
◇ InfiniBand SDR HCA : 8枚
◇ 3m接続ケーブル : 8本
◇ 3年間のサポートを含む

◆ その他
◇ ネットワーク : 10GbE対応の24ポートGbEスイッチ (10GbE x2、GbE x24)
◇ EIAラック : 24U or 42U (選択可能)
◇ オンサイト作業 : オンサイト・セットアップ
◇ 輸送費
◇ 3年間のサポートを含む

お勧めポイント

◇ メモリはコアあたり2GB搭載
◇ オプションでInfiniBandに対応
◇ 極めて信頼性の高いRAID10によるストレージを搭載
◇ ストレージの拡張性も高い
◇ ストレージ性能への要求に応える10GbEを標準採用
◇ MPI並列、ノード内並列、非並列などの計算をLSF経由で混在投入可
◇ LSFの採用によりシステムアイドル時間が低下し利用効率が大幅に向上
◇ 管理サーバを分離することでシステムがより安定稼動
◇ EIAラックのラックスペースに余裕があり大規模クラスタへの発展が可能
◇ 恒常性のある拡張を考慮して『HPC-ProCluster Std.』を採用
◇ アーキテクチャから開発環境まで環境の一貫性が保てる

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Xeon 16node 32CPU 128core 256GBメモリ + ホスト機 : 1390万円 (税込み)

大規模並列計算を必要とするMD計算や流体の要求に応えるコア数
高速ネットワークにもオプション対応
研究室の多数の方が共同利用できるHPCクラスタ

◆ 計算サーバ : DPe1950 8node 64core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 3.0GHz 8core/node
◇ メモリ : 16GB/node
◇ システムディスク : 250GB SATA
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 管理サーバ兼ファイルサーバ : DPe2920 1node 4core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 4core/node
◇ メモリ : 4GB/node
◇ システムディスク : 80GB (RAID1 80GB x2)
◇ SAS接続外付けストレージ : 2TB (RAID10 + スペア 500GB x9)
◇ 10GbE NIC : 1ポート
◇ 電源 : 2重化電源
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 開発環境 : Intel Fortran、C/C++、MKL、Intel-MPI (オプション)
※ MPI並列利用時、IB搭載時はIntel-MPIは必須
※ 開発環境ライセンスタイプは利用状況に応じて選択
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ 管理機能 : ホームディレクトリ、開発環境、ライセンス、ユーザ情報、ジョブ管理
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 高速システムインターコネクト SDR 10Gbps (オプション、別途340万円)
◇ InfiniBand SDR 24port SW : 1台
◇ InfiniBand SDR HCA : 16枚
◇ 3m接続ケーブル : 16本
◇ 3年間のサポートを含む

◆ 高速システムインターコネクト DDR 20Gbps (オプション、別途470万円)
◇ InfiniBand DDR 24port SW : 1台
◇ InfiniBand DDR HCA : 16枚
◇ 3m接続ケーブル : 16本
◇ 3年間のサポートを含む

◆ その他
◇ ネットワーク : 10GbE対応の24ポートGbEスイッチ (10GbE x2、GbE x24)
◇ EIAラック : 24U or 42U (選択可能)
◇ オンサイト作業 : オンサイト・セットアップ
◇ 輸送費

お勧めポイント

◇ メモリはコアあたり2GB搭載
◇ オプションでInfiniBandに対応
◇ 極めて信頼性の高いRAID10によるストレージを搭載
◇ 外付けディスクエンクロージャの採用でストレージの拡張性が高い
◇ ストレージ性能への要求に応える10GbEを標準採用
◇ MPI並列、ノード内並列、非並列などの計算をLSF経由で混在投入可
◇ LSFの採用によりシステムアイドル時間が低下し利用効率が大幅に向上
◇ 管理サーバを分離することでシステムがより安定稼動
◇ EIAラックのラックスペースに余裕があり大規模クラスタへの発展が可能
◇ 恒常性のある拡張を考慮して『HPC-ProCluster Std.』を採用
◇ アーキテクチャから開発環境まで環境の一貫性が保てる
※ ラック2台で実装される場合は、GbEスイッチ間をスタック接続すると良い

実際の実装状態例

右写真はHPCテクノロジーズ社内で設定中の「Quad-Core Xeon 16node 32CPU 128core InfiniBand HPCクラスタ」です。上段にはDPe2950 2UサーバやInfiniBandスイッチ、GbEスイッチなどが搭載されています。最下段には管理サーバ用に安定した電源を供給するためのUPSが搭載されています。ラックは42Uラックを用いていますから、まだ18Uの空きスペースがあり、さらに16node 32CPU 128coreを追加搭載することができます。するとラック全体ではXeon 32node 64CPU 256coreを搭載でき、それこそ計算センター級の素晴らしい演算性能を確保できます。

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Xeon 8node 16CPU 64core 128GBメモリ + 高速スクラッチディスク + ホスト機 : 1070万円 (税込み)

大容量スクラッチディスクを必要とする量子化学計算や画像処理などに適した構成
大容量かつ高速スクラッチディスクを搭載
研究室の多数の方が共同利用できるHPCクラスタ

◆ 計算サーバ : DPe2950 8node 64core (2Uサーバ)
◇ CPU : Quad-Core Xeon 3.0GHz 8core/node
◇ メモリ : 16GB/node
◇ システムディスク : 250GB SATA
◇ スクラッチディスク : 2TB (RAID0 500GB SATA x4) /node
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 管理サーバ兼ファイルサーバ : DPe2920 1node 4core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 4core/node
◇ メモリ : 4GB/node
◇ システムディスク : 80GB (RAID1 80GB x2)
◇ SAS接続外付けストレージ : 2TB (RAID10 + スペア 500GB x9)
◇ 10GbE NIC : 1ポート
◇ 電源 : 2重化電源
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 開発環境 : Intel Fortran、C/C++、MKL、Intel-MPI (オプション)
※ MPI並列利用時、IB搭載時はIntel-MPIは必須
※ 開発環境ライセンスタイプは利用状況に応じて選択
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ 管理機能 : ホームディレクトリ、開発環境、ライセンス、ユーザ情報、ジョブ管理
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ その他
◇ ネットワーク : 10GbE対応の24ポートGbEスイッチ (10GbE x2、GbE x24)
◇ EIAラック : 24U or 42U (選択可能)
◇ オンサイト作業 : オンサイト・セットアップ
◇ 輸送費

お勧めポイント

◇ メモリはコアあたり2GB搭載
◇ オプションでInfiniBandに対応
◇ 高速・大容量スクラッチディスクの搭載
◇ 極めて信頼性の高いRAID10によるストレージを搭載
◇ 外付けディスクエンクロージャの採用でストレージの拡張性が高い
◇ ストレージ性能への要求に応える10GbEを標準採用
◇ MPI並列、ノード内並列、非並列などの計算をLSF経由で混在投入可
◇ LSFの採用によりシステムアイドル時間が低下し利用効率が大幅に向上
◇ 管理サーバを分離することでシステムがより安定稼動
◇ EIAラックのラックスペースに余裕があり大規模クラスタへの発展が可能
◇ 恒常性のある拡張を考慮して『HPC-ProCluster Std.』を採用
◇ アーキテクチャから開発環境まで環境の一貫性が保てる
◇ 複数のDPe2950をHPCで使用するので、音の問題から居室での使用には難あり

実際の実装状態例

右写真はHPCテクノロジーズ社内で設定中のDPe2950 2Uサーバを用いた「Quad-Core Xeon 11node22CPU 88core HPCクラスタ」です。上段にはDPe2950 2UサーバやGbEスイッチなどが搭載されます。最下段には管理サーバ用に安定した電源を供給するためのUPSが搭載されています。ラックは42Uラックを用いていますから、まだ13Uの空きスペースがあり、さらに6node 12CPU 48coreを追加搭載することができます。するとラック全体ではXeon 17node 34CPU 136coreを搭載できます。もちろん各ノードに2TBのスクラッチディスクを搭載できすから、スクラッチディスクだけでも34TBという途方も無いシステムです。

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Xeon 12node 24CPU 96core 192GBメモリ + ホスト機 : 13,545,000円 (税込み)

MD計算、流体計算、量子化学計算、有限要素法計算などを1基で実現
多数のCPUコアと、高速大容量なスクラッチディスクを搭載
研究室の多数の方が共同利用できるHPCクラスタ

◆ 計算サーバ (並列計算用) : DPe1950 8node 64core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 3.0GHz 8core/node
◇ メモリ : 16GB/node
◇ システムディスク : 250GB SATA
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 高速システムインターコネクト SDR 10Gbps (オプション、別途220万円)
◇ InfiniBand SDR 24port SW : 1台
◇ InfiniBand SDR HCA : 8枚
◇ 3m接続ケーブル : 8本
◇ 3年間のサポートを含む

◆ 計算サーバ (スクラッチディスク使用計算用) : DPe2950 8node 64core (2Uサーバ)
◇ CPU : Quad-Core Xeon 3.0GHz 4core/node
◇ メモリ : 16GB/node
◇ システムディスク : 250GB SATA
◇ スクラッチディスク : 2TB (RAID0 500GB SATA x4)
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 管理サーバ兼ファイルサーバ : DPe2920 1node 4core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 4core/node
◇ メモリ : 4GB/node
◇ システムディスク : 80GB (RAID1 80GB x2)
◇ SAS接続外付けストレージ : 2TB (RAID10 + スペア 500GB x9)
◇ 10GbE NIC : 1ポート
◇ 電源 : 2重化電源
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 開発環境 : Intel Fortran、C/C++、MKL、Intel-MPI (オプション)
※ MPI並列利用時、IB搭載時はIntel-MPIは必須
※ 開発環境ライセンスタイプは利用状況に応じて選択
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ 管理機能 : ホームディレクトリ、開発環境、ライセンス、ユーザ情報、ジョブ管理
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ その他
◇ ネットワーク : 10GbE対応の24ポートGbEスイッチ (10GbE x2、GbE x24)
◇ EIAラック : 24U or 42U (オプションとして選択可能)
◇ オンサイト作業 : オンサイト・セットアップ
◇ 輸送費

お勧めポイント

◇ メモリはコアあたり2GB搭載
◇ オプションでInfiniBandに対応
◇ 高速・大容量スクラッチディスクの搭載
◇ 極めて信頼性の高いRAID10によるストレージを搭載
◇ 外付けディスクエンクロージャの採用でストレージの拡張性が高い
◇ ストレージ性能への要求に応える10GbEを標準採用
◇ MPI並列、ノード内並列、非並列などの計算をLSF経由で混在投入可
◇ LSFの採用によりシステムアイドル時間が低下し利用効率が大幅に向上
◇ 管理サーバを分離することでシステムがより安定稼動
◇ EIAラックのラックスペースに余裕があり大規模クラスタへの発展が可能
◇ 恒常性のある拡張を考慮して『HPC-ProCluster Std.』を採用
◇ アーキテクチャから開発環境まで環境の一貫性が保てる
◇ 複数のDPe2950をHPCで使用するので、音の問題から居室での使用には難あり
※ ラック2台で実装される場合は、GbEスイッチ間をスタック接続すると良い

 

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センター水準の大規模クラスタ構成例

Quad-Core Xeon搭載の1Uサーバを用いたXeon 256CPUコアの高密度実装構成例です。256CPUコア + ネットワークスイッチ + オプションのインフィニバンドスイッチを含めてラック1台に余裕を持って搭載できます。管理サーバ部はイラスト左側のような構成となり、別ラックへの搭載となります。

◇ Quad-Core Xeonを搭載し最高水準の性能
◇ ラック1台のスペースに256コア搭載
◇ 高速並列計算はInfiniBandで実現
◇ 10GbE対応ストレージ性能を搭載
◇ スイッチ間は42Gbpsの高速スタック接続
◇ 『HPC-ProCluster Std.』により構成を標準化
◇ 最新の開発環境の導入を実施
◇ 商用アプリケーションのライセンス管理に対応
◇ ソースコードからアプリケーションビルドを実施
◇ システム構築、設置、運用支援まで実施
◇ LSFの導入で計算リソースの有効活用
◇ 実績の管理サーバとファイルサーバを搭載

◇ 動作音が低く作業室などにも設置できる
◇ Dellワークステーションを採用し高品質
◇ DellのサポートとHPCテクノロジーズによる安心の3年間オンサイトWサポート (5年間まで延長可能)

※ 3年間の当時オンサイト保守なら、万一のディスク故障でも当日か翌営業日には修理担当がその場で修理。
※ 3年間の当時オンサイト保守では、部品費用も修理費用も一切無料です。
※ 面倒で時間もかかるセンドバックは昔の話。ファイルサーバには『3年間の当日オンサイト保守』必要不可欠。

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[CPU部] Xeon 32node 64CPU 256core 256GBメモリ: 20,790,000円 (税込み)

Quad-Core Xeonによりラック1台で256CPUコアを高密度搭載
高速並列計算の用途にはオプションでInfiniBandスイッチを用意
ホスト側のスイッチ間は48Gbpsの高速スタック接続
Dell製の高品質サーバを魅力的な価格で提供
3年間のオンサイト保守で安心運用

◆ 計算サーバ : DPe1950 32node 256core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 3.0GHz 8core/node
◇ メモリ : 8GB/node
◇ システムディスク : 250GB SATA
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ ネットワークスイッチ HPC-ProSwitch DPc6248 1台
◇ GbEポート : 48ポート
◇ 10GbEポート : オプション
◇ 48Gbpsスタック接続I/Fカード : 1枚
◇ サポート : 翌営業日交換品発送保守サービス (3年間)

◆ その他
◇ 高速システムインターコネクト (オプション)
◇ EIA 42Uラック (オプション)

※ 管理サーバ部は別売

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[管理サーバ部] RAID10実効容量10TB Xeon4コア 4GBメモリ (10GbE接続)
+ 管理サーバ + 10GbE対応イーサネットスイッチ : 4,725,000円
(税込み)

◆ 管理サーバ部 : DPe1950 1node 4core
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 4core/node
◇ メモリ : 4GB/node
◇ システムディスク : 80GB (RAID1 80GB x2)
◇ 電源 : 2重化電源
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ 開発環境 : Intel Fortran、C/C++、MKL、Intel-MPI (オプション)
※ MPI並列利用時、IB搭載時はIntel-MPIは必須
※ 開発環境ライセンスタイプは利用状況に応じて選択
◇ 自動負荷分散ソフト : LSF
◇ システム構築 : HPC-ProCluster Std.
◇ 管理機能 : ホームディレクトリ、開発環境、ライセンス、ユーザ情報、ジョブ管理
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守
※ 開発環境ライセンスはフローティングライセンスが基本

◆ ファイルサーバ (ホスト部) : DPe2950 (2U)
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 8core
◇ メモリ : 4GB (最大32GB)
◇ RAIDコントローラ : Dell PERC5/e x 1 (SAS 12Gbpsポート x 2)
◇ システムディスク : 80GB x2 RAID1
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ NIC : GbE x 2 (10GbE x 2オプション)
◇ 電源など : 2重化電源、FAN冗長化
◇ 管理ツール : 総合管理ツール、LCD表示機能、電子メール障害通知機能
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ ファイルサーバ (外付けディスクエンクロージャ部) : DPm1000 2台
◇ 搭載ディスク : SATA 750GB 7200rpm x 30個 (22.5TB)
◇ RAID10 10TB構成 : (2TB + 1.5TB x + 共有スペアディスク 1個) x 2
◇ 電源など : 2重化電源、FAN冗長化
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守
※ RAID10 9TB構成も可能 : (1.5TB x 3 + 共有スペアディスク 3個) x 2台

◆ ネットワークスイッチ HPC-ProSwitch DPc6224 1台
◇ GbEポート : 24ポート
◇ 10GbEポート : 2ポート
◇ 48Gbpsスタック接続I/Fカード : 1枚
◇ サポート : 翌営業日交換品発送保守サービス (3年間)

◆ その他
◇ オンサイト作業 : オンサイト設置 (ラッキング)、オンサイトセットアップ
◇ EIA 42Uラック : (オプション)
◇ 輸送費 : 含む

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Xeon 64node 128CPU 512core 512GBメモリ + 管理サーバ : 52,290,000円 (税込み)

より大規模なシステム構成例です。特徴としてはスイッチ間を48Gbpsのスタック接続を利用していることにあります。もちろん、ディスクとは12GbpsのSAS接続、ファイルサーバとは10Gbps Ethernet接続とバランス良く高速化されています。大型計算機で実績のあるジョブスケジューラLSFが搭載されており、大型計算機並みの共同計算機利用環境を構築可能です。InfiniBandはオプションです。

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Xeon 128node 256CPU 1024core 1TBメモリ + 管理サーバ : 104,479,000円 (税込み)

さらに大規模なシステム構成例です。特徴としてはスイッチを2重化することで、48Gbpsのスタック接続が2重化され96Gbpsの帯域を確保していることです。(帯域が主でHAは副産物) 研究室に設置するクラスタとしては最高レベルのシステムです。

[ファイルサーバのアップグレード例]

上記構成でファイルサーバをさらにアップグレードする必要ある場合には、ホスト機を拡張性の高いDPe2900に置き換え、サーバに搭載するSAS RAIDコントローラや10GbEコントローラなどを複数搭載し、それらの総合帯域を拡張させることができます。

◇ クラスタとは48Gbpsスタック接続を2重化 総帯域96Gbps
◇ スイッチとホスト間は10Gbpsを4重化 総帯域40Gbps
◇ ディスクとホスト間は12Gbps SAS接続を4重化 総帯域48Gbps

◆ ホストサーバ : DPe2900FS (5U)
◇ CPU : Quad-Core Xeon 1.6GHz 8core
◇ メモリ : 24GB (最大48GB)
◇ RAIDコントローラ : Dell PERC5/e x 2 (SAS 12Gbpsポート x 4)
◇ システムディスク : 80GB x2 RAID1
◇ OS : Cent OS (RedHat OSはオプション)
◇ NIC : GbE x 2 + 10GbE x 4
◇ 電源など : 2重化電源、FAN冗長化
◇ 管理ツール : 総合管理ツール、LCD表示機能、電子メール障害通知機能
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

◆ 外付けディスクエンクロージャ : DPm1000 8台
◇ 搭載ディスク : SATA 1TB 7200rpm x 120個 (120TB)
◇ RAID10 48TB構成 : (2TB x 24 + 共有スペアディスク 24個)
◇ 電源など : 2重化電源、FAN冗長化
◇ サポート : 3年間の当日オンサイト保守

2重化・高速スタックを採用したファイルサーバ部のラッキング例

 

※ 高速で安定した計算機ほどデータ量が急増するため、ファイルサーバのラッキングでは拡張性を考慮し、ディスクエンクロージャの追加スペース確保やシステム設計での配慮が大切です。写真のシステムではラックに十分なスペースが確保され、サーバ機にも拡張性の高い2U筐体が採用されています。

 

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[追加オプション] 高速スクラッチディスク『ExtremeDisk』

Gaussianなどのアウトコアソルバを使用する大規模計算では高速かつ大容量なスクラッチディスクの搭載が必要とされます。そこで、各ノードに搭載できる高速なRAID0によるスクラッチディスク追加キット『ExtremeDisk』をご提供します。

◇ この高速スクラッチディスクオプションはノード毎に搭載
◇ 一部のノードだけへの搭載も可能
◇ 一部のノードだけに搭載した場合はLSFに指定することで選択的に利用可能

1TB 高速・大容量SATAスクラッチディスク : 105,000円 (税込み)
◆ 1TB SATA H/W RAID0
◇ H/W RAIDコントローラ : SAS5iR
◇ ディスクドライブ : 500GB SATA 7500rpm x2 (高速・大容量ドライブ採用)
◇ スクラッチディクス用ハードウェアチューニングExtremeDisk仕様

2TB 高速・大容量SATAスクラッチディスク : 178,500円 (税込み)
◆ 2TB SATA H/W RAID0
◇ H/W RAIDコントローラ : SAS5iR
◇ ディスクドライブ : 500GB SATA 7500rpm x4 (高速・大容量ドライブ採用)
◇ スクラッチディクス用ハードウェアチューニングExtremeDisk仕様
※ ラック型筐体ではDPe2950に搭載可能、タワー型ならDPe2900に搭載可能

900GB 超高速SASスクラッチディスク : 315,000円 (税込み)
◆ 900GB SAS H/W RAID0
◇ H/W RAIDコントローラ : SAS5iR
◇ ディスクドライブ : 300GB SAS 15000rpm x3 (超高速ドライブ採用)
◇ スクラッチディクス用ハードウェアチューニングExtremeDisk仕様

2TBGB 超高速SASスクラッチディスク : 630,000円 (税込み)
◆ 2TB SAS H/W RAID0
◇ H/W RAIDコントローラ : SAS5iR
◇ ディスクドライブ : 300GB SAS 15000rpm x7 (超高速ドライブ採用)
◇ スクラッチディクス用ハードウェアチューニングExtremeDisk仕様
※ ラック型筐体、タワー型筐体共にDPe2900に搭載可能

お勧めポイント

◇ CPUに負担の少ないハードウェアRIAD0を採用
◇ スクラッチディスク専用の高速ディスクチューニングExtremeDiskの実施により、ケースによっては従来構成のRAID0より20%の性能向上を確認。

※ 3年間の当時オンサイト保守なら、万一のディスク故障でも当日か翌営業日には修理担当がその場で修理。
※ 3年間の当時オンサイト保守では、部品費用も修理費用も一切無料です。
※ 面倒で時間もかかるセンドバックは昔の話。ファイルサーバには『3年間の当日オンサイト保守』必要不可欠。

■ ExtremeDisk導入事例
■ ExtremeDiskセットアップサービス

 

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[追加オプション] InfiniBandキット

AMBERやVASPなどのような高並列による実行が可能なアプリケーションでは高速化を実現するためにInfiniBandが求められます。InfiniBandのインテグレーションで大切なことは、単にMPIで正常に並列動作させるだけで終わらせず、得られた性能が妥当か否かの検討と対応までを確実に行うことです。

HPCテクノロジーズは、沢山のベンチマーク結果が系統付けて蓄積されており、これらをリファレンスとしながら各クラスタ毎の設定を行うことで、手堅いインテグレーションをご提供しています。

◇ このオプションサービスでスイッチとNICやケーブルをセットで提供
◇ WEB上の組み合わせは8ノードと16ノードのキット
◇ ご要望に応じてより高い並列度の構成も提供できる

InfiniBand SDR 8ポート・キット : 2,415,000円 (税込み)
◇ InfiniBand SDR SW : 24ポート
◇ InfiniBand SDR PCIe HCA : 8枚
◇ InfiniBand 3mケーブル : 8本
◇ 3年間のサポートを含む

InfiniBand SDR 16ポート・キット : 3,570,000円 (税込み)
◇ InfiniBand SDR SW : 24ポート
◇ InfiniBand SDR PCIe HCA : 16枚
◇ InfiniBand 3mケーブル : 16本
◇ 3年間のサポートを含む

InfiniBand DDR 16ポート・キット : 4,935,000円 (税込み)
◇ InfiniBand DDR SW : 24ポート
◇ InfiniBand DR PCIe HCA : 16枚
◇ InfiniBand 3mケーブル : 16本
◇ 3年間のサポートを含む

導入の一口アドバイス

◇ マルチコア機でのGbE MPICH並列で性能が伸びない場合はIntel-MPIで良くなる場合がある
◇ マルチコア機でのGbE Intel MPI並列で2node 4CPU 16core程度から通信飽和が出る場合がある
◇ 経験的に8〜16node程度ではSDRとDDRの性能差が顕在化することは少ない
※ 弊社は多数のベンチマークを行っていますので、是非ともお問い合わせをおねがいします

 

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[追加オプション] EIA-24Uラック、EIA-42Uラック

HPCテクノロジーズではDell純正のEIAラックを採用しています。このラックは非常に良く出来たラックで、操作性が良く、実装密度も高く、冷却性能にも優れています。

◇ 42Uラックの高さが200cm以下なのでドア枠との干渉が少ない
◇ 42U (24U) がフルに使える
◇ Dellサーバや付属レールと共通設計で収まりが最高
◇ Dellの豊富なオプション類を何時でも確実に追加搭載できる
◇ パンチングメタルによる開口面が大きく通風が良い
◇ 前方と横方に転等防止用のフランジを装着できる
◇ 写真のように背面が観音開きのため、後ろのスペースを節約できる
◇ 背面扉の下部にケーブル取り出し用の切り欠きがあり便利
◇ ラック側面にKVM切り替え機などを収納するフックが豊富にある

DPe2410 (EIA-24Uラック) : 231,000円 (税込み)

◇ 搭載可能ユニット数量 : 22U
◇ 搭載可能重量 : 544kg
◇ サイズ : 奥行き100cm、幅64cm、高さ120cm
◇ 本体重量 : 110kg
◇ 写真は24Uラックと42Uラック

DPe4210 (EIA-42Uラック) : 252,000円 (税込み)

◇ 搭載可能ユニット数量 : 42U
◇ 搭載可能重量 : 907kg
◇ サイズ : 奥行き100cm、幅64cm、高さ200cm
◇ 本体重量 : 170kg
◇ 写真は24Uラックと42Uラック

設定中のラックが林立するHPCテクノロジーズ製造部

HPCテクノロジーズの製造部 (千代田区飯田橋) では、サーバと補助機器類やラックなどが入荷すると、そこから約2週間の工程でHPCクラスタとして完成品させ、順次全国のお客様に出荷しています。撮影時には2台のラックを搬出し、6台のラックが仕掛かっていました。また手前では4セットのWSベースのクラスタが設定されており活気にあふれていました。