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HPC計算機導入事例

ファイルサーバ導入事例 (抜粋)

Gaussian導入事例 (抜粋)

(導入例) Gaussian静音サーバ Xeon 1node 2CPU 4core【大学・導入事例】

お客様の状況

お客様は、実験がメインの研究室で、Gaussianの計算は補助的に使用されています。補助的ではありますが、実験系のため計算規模は大規模になり、数週間もかかる計算もあるそうです。大規模計算を目的とするため、メモリサイズ、スクラッチディスクサイズや計算に費やす時間制限などを気にせずに投入できる計算機環境を必要とされています。そのためには手元に置いた自前の「道具としての大規模Gaussian計算環境」である必要があるそうです。また、計算機に関してはあまり詳しくはない先生方なので、セットアップから導入後のオンサイト保守まで含めてサポートしてくれるベンダーからの購入を希望されていました。

お客様の要望

1. Gaussianのセットアップまで全て安心して任せられる会社にシステムインテグレーションをやってほしい。
2. Gaussianの性能を引き出すようなハードウェアチューニングをしてほしい。
3. 並列計算も必要、シリアル計算の並行処理も必要。
4. ジョブ管理スケジューラを導入して欲しい。
5. システムは静かなものがほしい。
6. システムの導入、運用、メンテナンスまでやってほしい。
7. 設置時に利用方法などを詳しく説明してほしい。
8. 堅牢なマシンを選定したい。
9. オンサイト対応してくれるサポート体制を整えて欲しい。

計算機の選択

上記のお客様のご要望を満たす計算機としてDPr490が適しています。Gaussianでの大規模計算を目指すなら、コア数、メモリサイズ、スクラッチディスクの容量と速度が、それぞれ大きいほうが良いからです。

最大Xeon 2CPU 8コアまで搭載できる
メモリ共有なので、メモリ共有での並列計算が可能
ディスクドライブベイが多く、大容量のディスクアレイを構築できる
メモリスロットが8スロット搭載可能で2GBのメモリで16GBのメモリを構成できる
CPUやメモリの冷却能力が高く、長期間の大規模ジョブにも安心
静粛性も高い

などの特徴を備えています。

お客様の要望を満たす構成

DPr490に8GBのメモリ、500GBスクラッチディスク、4個のコアを搭載し、64bit動作するGaussian計算環境を構築することで高速なGaussian計算環境を実現します。

Linux上で動作するGausian環境では複数の利用者が同時にリモートログインし計算することが可能になり、複数ユーザーでの共同利用が可能です。

4コアが搭載されているので、4ジョブ同時実行でも、4並列計算でも、2並列計算の2ジョブ実行でも、柔軟なジョブ投入が可能となっています。

ジョブ管理ソフトが搭載されているのでユーザー同士が計算機の取り合いを行うことが無い利用環境になっています。
弊社でGaussian動作環境の設定までサポートしており、お客様は計算に専念することができます。

基幹コンポートネントは全てデル製品を採用

Gaussianではスクラッチディスクを激しく連続I/Oします。このスクラッチディスクが故障すると計算は停止するため、迅速な復旧が求められます。もし大切な計算中に故障でセンドバック保守を行うとなると2週間から一月は仕事がストップしてしまい困ります。そこで計算機のみならず、ディスクドライブもデルの純正品を採用することで、デルサポートによる迅速なオンサイト修理の実施と、無償修理パーツ保証が受けられ、万一の故障時にも迅速な復旧が無償で可能です。その結果、長期間に亘り稼働時間を最大化できます。

HPCテクノロジーズとデルサポートによる「Wサポート」の実現

HPC計算機の安定運用には、ハードウェアのサポートのみならず、システムのサポートも欠かせません。HPCテクノロジーズの製品はHPCテクノロジーズとデルサポートによる、安心の「Wサポート」がお客様の快適な計算環境をがっちり支えています。

お納めしたシステム

お納めしたHPCクラスタシステムについて

HPC-ProServer DPr490 1ノード (本計算)

CPU : デュアルコアXeon 2CPU4コア
メモリ : FB-DIMM 667MHz 8GB
HDD : 250GB x 2本 (システムディスク + システムバックアップ)
スクラッチディスク : 500GB