VASP (Hg) による計算機の性能評価

システム構成	ノード数	CPU 数	コア数	プロセス数	elapsed time (sec)
HPC-ProServer DPrT5400 45nm Q/C Xeon X5450 3.0GHz DDR2 667MHz 16GB、C/S Intel5400 (2008.1.18)	1	2	8	1	80.3
				2	42.2
				4	24.6
				8	19.1
HPC-ProServer DPe1950 Q/C Xeon X5365 3.0GHz DR2 667MHz 16GB、C/S Intel5000X	1	2	8	1	88.2
				2	53.0
				4	33.2
				8	25.4
HPC-ProServer DPe1950 Q/C Xeon X5355 2.66GHz DDR2 667MHz 8GB、C/S Intel5000X	1	2	8	1	103.4
				2	58.3
				4	36.1
				8	26.1
(最適動作をMPIトレースツールにて検討) Q/C Xeon X5355 2.66GHz DDR2 667MHz 4GB/node C/S Intel 5000X System Inter Connect: InfiniBand (10Gbps, Cisco) (2007.2.22)	1	2	8	1	93.3
				2	50.1
				4	28.9
				8	24.6
	2	4	16	2	52.7
				4	29.1
				8	17.6
				16	15.4
	4	8	32	4	28.7
				8	17.4
				16	11.3
				32	12.8
	8	16	64	8	17.1
				16	11.2
				32	9.7
				64	-

VASP (Hg) による「Xeon X5450 2CPU 8Core」の性能評価 (2008.1.21)

45nmプロセスを採用する最新のQuad-Core Xeon X5450 3.0GHz 2CPU 8Coreを搭載した計算機の納入テストにてVASPによる動作確認が実施されました。結果は、単体の2CPU 8Core環境にて19.1秒という非常に良い性能を確認しました。同一クロックで動作するXeon X5365 3.0GHzと計算時間を並列度順に比較すると、91%、79%、74%、75%と差が大きくなっていました。。

「Quad-Core Xeon 8-node 64Core InfiniBand + Intel-MPI」機のベンチ (2007.2.22)

VASP水銀の計算により、Quad-Core Xeon 8node 64Core InfiniBand + Intel-MPI並列機の性能評価テストをお客様にお願いしました。結果は、1node 8CPU並列で24.5秒、2node 16CPU並列15.4秒と良い性能が確認されました。さらに、InfiniBand接続の8node 32CPU並列で記録した9.7秒という速度は非常に高速であるとのことでした。

構成について

VASP用のエントリー機としてなら、単体の2CPU 8Core機でも十分高速で、24.5秒という性能を実現しています。
大規模計算にはQuad-Core Xeon InfiniBand + Intel-MPI並列が優れています。

動作環境

System : HPC-ProServer DPe1950 8台
CPU : Quad-Core Xeon 2.66GHz/8MB(L2) FSB1333MHz 8node 16CPU 64CPUコア
MPI : Intel-MPI
Mem : DDR2-667 4GB/node
OS : CentOS 4.4 (64bit Linux)
System Interconnect : InfiniBand (10Gbps, Cisco製)
Compiler : Intel Fortran Version 9.1 Build 20060323
Math Lib : Intel Math Kernel Library v8.1
MPI : Intel MPI v3.0

参考

■ Qual-Core Xeon 2.66GHz 8node 16CPU 64CPUコア Intel-MPI + InfiniBandクラスタ予備テスト結果
■ Cisco SFS7000P InfiniBand サーバスイッチ